In ihren verschiedenen Antragsverfahren fördert die EKFS Medizinerinnen und Mediziner, die Forschung und Klinik in ihrem Berufsweg verbinden wollen (Clinician Scientists), Nachwuchswissenschaftlerinnen und Nachwuchswissenschaftler, die in der Medizin arbeiten, sowie Forscherinnen und Forscher mit Schlüsselprojekten, die Durchbrüche in der Diagnose und Therapie von Erkrankungen erwarten lassen.

In der Translatorik-Förderlinie werden anwendungsorientierte Forschungsprojekte gefördert, die helfen sollen, Lücken zwischen medizinisch-naturwissenschaftlicher Grundlagenforschung und ihrer Anwendung im klinischen Alltag möglichst rasch zu schließen.